数字切片库基本简介
数字切片是利用全自动显微镜扫描系统,结合虚拟切片软件系统,把传统玻璃切片进行扫描、无缝拼接,生成一整张全视野(Whole Slide Image, 简称WSI)的数字切片(也称虚拟切片)。在病理学医、教、研实践中,数字切片具有传统切片的所有功能,并具有不受空间与时间限制的优点。数字切片并非一张静态图片,它是包含了玻璃切片上的所有病变信息,在计算机上,如同在显微镜下,可进行不同倍率观察(4倍,10倍,20倍,40倍,100倍等),并在一定范围内(1X~100X),实现无级连续变倍浏览切片;而将这些海量的数字切片统一进行分类、归档、并存储在服务器中,就形成了数字切片库。
通过计算机与网络系统,进行数字切片库的管理,相对于传统的玻璃切片管理方式具有巨大的优势,其不受空间与时间限制,使用更方便、功能更强大、应用更广泛。数字切片库的产生,给教学、病理诊断、远程会诊、科学研究等注入了全新的应用方向。
数字切片的制作,是利用数字切片扫描系统,把玻璃切片进行数字化成一张完整切片,系统包括显微镜扫描平台、专业摄像头、扫描控制软件、图像压缩与存储等软硬件,是集多种技术与多学科于一体的系统产品。
要想将此数字切片放大到40倍,而且要求是光学变焦,并非数码变焦,这样最后一个图片的像素要求达到近19亿像素,要想达到这样高的参数,则需要用专业的切片扫描设备。往往一张数字切片的存储需要20G左右,目前在国际上已经出现了很多这种设备,最后将扫描完的切片可以压缩到400M左右,并且实现一张切片的扫描时间也非常之短,仅仅用3分钟(TDI线性扫描技术才可以实现这么短的时间)就可以完成一张数字切片的制作。
目前数字切片的扫描方式存在两种:
一、传统的方式就是在显微镜上装配一个高分辨率的CCD相机进行拍照,这样将高倍放大的玻璃切片图像进行局部的多次的拍照,并将最后生成的N多张图片利用计算机的软件功能组合成一个整张的切片图像,这样就完成了数字切片的制作,此方法比较落后,这样扫描成的一个图像所需要的时间往往达到10几分钟,而且采集的画质图像分辨率不够。
二、目前最新的是TDI-CCD线性扫描技术(,此扫描技术不是拍照拼接方式,而类似于我们办公用的扫描仪,TDI-CCD图像传感器在物体上移动扫描的同时,图像即传输到计算机上,这样扫描的速度非常之快,再加上他的高分辨率、高灵敏度,可以让每个像素点达到0.23um(微米),当然此TDI-CCD传感器的造价成本也是很高的,以前宇航拍摄哈雷彗星运动轨迹时即采用的此种技术。
目前国际上可以拥有此种扫描设备的公司有:日本的HAMAMATSU(在中国的代理是北京滨松光子技术股份有限公司)、美国的UNIC、日本的奥林巴斯、中国的MOTIC等,但此上述公司中使用的扫描技术是不同的,成像的画质也有差别。
此网站上有些已经制作好的数字切片,扫描设备见图,此图片由日本HAMAMATSU提供, 设备名称为Nanozoomer Digital Pathology (简称NDP)
数字切片库是什么?
将大量的数字切片分类归档存储在服务器中,这样建立一个资源库,即为数字切片库。
目前北京协和医科大学(北京协和医院病理科)、浙江大学医学院、中国医科大学基础医学院已经拥有了此种技术。
随着WSI(全视野数字切片)技术和产品的推广,数字切片在病理诊断中得到了广泛的应用,国家卫生部率先采用以WSI为核心的数字病理远程会诊平台,成立了"卫生部病理质控中心",平台浏览技术采用了Silverlight浏览和HTML浏览两种方式。
卫生部利用该平台技术针对"肿瘤的规范化诊治"进行的病理图像远程专家诊断、复诊和质控评价的一种信息化技术应用。该技术的实施,可有效的解决基层医院病理诊断困难而导致的诸多临床技术问题,从而确实对提高基层医院的整体医疗技术水平发挥重要作用。
各基层医院试点单位利用该平台,将病理切片,通过WSI扫描成数字化切片后,随同病理数据资料,利用网络远距离传送到网络会诊服务平台,专家通过此平台,可随时随地进行病理会诊,在计算机上进行WSI阅片,如同在显微镜下进行观察、诊断,为病理医师提供了足够的诊断信息。这种方式与传统病理远程会诊相比较,它解决了静态图片会诊方式时切片视野选样误差和图像质量等问题,也解决了动态实时遥控显微镜会诊方式受限于图像质量、时间与空间等。且若网络条件合适,结合数字切片远程会诊和实时远程遥控显微镜模式,实现常规、疑难病理病例和冰冻切片的及时诊断。
数字切片扫描与应用系统,应用于卫生部病理远程会诊试点项目:
卫生部病理远程会诊试点-省级中心
中国医科大学附属第一医院
哈尔滨医科大学附属第三医院
江苏省人民医院
山东省立医院
河南省人民医院
山西省肿瘤医院
山西省立医院
福建省立医院
安徽医科大学第一附属医院
江西省人民医院
中南大学湘雅医院
中山大学附属第一医院
浙江省肿瘤医院
华中科技大学附属同济医院
贵阳医学院附属医院
成都军区昆明总医院
西安交通大学医学院第一附属医院
青海省人民医院
新疆自治区人民医院
重庆医科大学附属第一医院
四川大学华西医院
卫生部病理远程会诊与质控试点单位
洛阳市中心医院
商丘市第一人民医院
驻马店市中心医院
东营市人民医院
菏泽市立医院
青岛市第三人民医院
寿光市人民医院
泰安市中心医院
牡丹江市肿瘤医院
七台河市人民医院
双鸭山市人民医院
新民市人民医院
鞍山市第四医院
瓦房店市中心医院
江苏大学附属医院
扬中市人民医院
昆山市人民医院
临汾市第一人民医院
吕梁市人民医院
晋中市第二人民医院
长治市潞安集团总医院
大同市第二人民医院
嘉兴市第二医院
丽水市人民医院
桐乡市第一人民医院
长沙市中心医院
株洲市331医院
株洲市二医院
株洲市一医院
湘潭市中心医院
漳州市漳浦县医院
厦门市中医院
珠海市第二人民医院
深圳龙岗区人民医院
贵溪市人民医院
九江医学院附属医院
乐平市人民医院
兴国县人民医院
马鞍山市人民医院
芜湖市第一人民医院
芜湖市第二人民医院
铜陵县人民医院
通城县人民医院
鄂州市中心医院
建始县人民医院
麻城市人民医院
喀什地区第一人民医院
伊犁州友谊医院
阿克苏地区第一人民医院
青海省第五人民医院
格尔木市人民医院
汉中市人民医院
大理州人民医院
昭通市第一人民医院
个旧市人民医院
镇雄县人民医院
黔东南州医院
黔江区中心医院
自贡市第一人民医院
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