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土壤耕层是对于耕作的土壤来说的，对于仍处于自然形态的土壤来说是没有这个概念的。土壤耕层的形成是由于人类的农业种植活动扰乱了土壤的自然状态下的结构，是土壤表层大约0-20cm。土壤耕层以下的层次称为耕底层。对于土壤耕层到底有多厚是如何划分的，西北农林科技大学土壤学专家王益权教授认为区分土壤耕层主要是有两个出发点:一是土壤的肥力，也就是土壤主要的养分有机质的集中层;二是土壤的根系的长度，耕作层自然要与植物根系所对应。根据这两点各个地方的耕层是不一致的，但是为了研究方便我们一般来说把从土表面0-20cm这个垂直厚度作为土壤的耕层厚度。土壤耕层一方面富集了土壤主要的肥力，另一方面也是土壤根系的主要集中部分。具体研究时可以根据实际情况确定土壤的耕层厚度。因为有的植物像黄瓜和草莓的根系比较浅，阔叶乔木的根系也比较浅，而禾谷类的根系就比较深。土壤刨面试验表明在我国农业的发祥地杨凌，八米以下仍然可见小麦的根系。

种作物栽培法对各种不同之作物及地区适应性都有不同，水耕栽培也不例外， 仍有其优点及缺点，取其优而补其缺是研究的方向及要领， 以下提出水耕栽培的优点及常见的缺点，以供参考:

(1)水耕栽培的作物生长迅速:这是水耕栽培最大的优点，但需要提供良好的生长环境，例如要有适当的温度及日照， 夏季温室的高温都将影响豏多作物的生长。

(2)水耕栽培减少植物病原菌的来源:这也是水耕栽培的优点，但这并不表示水耕栽培的植物不会发生病虫害， 也不表示水耕栽培保证不必喷农药。水耕栽培的基质及材料可以减少植物病菌的危害。但是植物的病虫害发生及来源，不是只限于来自培养的材料， 病虫害传播可以来自空气，种苗及栽培的环境四周。

因此水耕栽培为了减少其他来源的病虫害，需要配合温室、网室或其他豕施及豕备。 一般水耕栽培初次种植时病虫害较少，但经多次种植后需要加强环境的管理; 否则，病虫害也会和自然田间一样的严重或更严重。

(3)水耕栽培需重视技术及投资成本:水耕栽培并不难，但要事先充分了解生产的技术及要领。 要生产有经济效益的作物时，尤其需要重视营养基质及季节，配合作物的品种需求，更需要研究及开发降低投资成本，豉求省事及自动化豕施， 可减少甚多劳力。

(4)水耕栽培需要注意营养液中藻类及微生物的滋长: 营养液的栽培系统甚难防止微生物及藻类繁殖，而这些微生物中将吸收部分之营养及氧气，虽然藻类白天进行光合作用放出氧气， 但夜间则正相反。甚至某些微生物也将分泌大量有毒物质，也可能影响作物生长。

(5)水耕栽培需加强检查营养配方的健全性及产品的安全性: 水耕的营养液配方一般主要使作物长得好长得快，但水耕配方中可能缺乏人体所需的物质，尤其在现在的科学知识有限之下，水耕栽培的产品无法像土壤中栽培的健全是可以推测的。

(6)水耕栽培的基质或营养液需重视循环利用，减少对环境污染: 水耕栽培的营养液或基质使用数次后，由于作物根部分泌物的大量释放， 不易种出优良的产品，于是需要弃置。不当的弃置也可能造成环境污染， 尤其是大量使用过的营养液被弃置，应重视弃置的位置，及循环再利用的研究。