巴州捷运工程机械运输有限责任公司

大庆车站新建工程:1998年7月7日完工启用。 大桥车站新建工程:2002年10月4日完工启用。 太原车站新建工程:2002年11月22日完工启用。 三坑车站新建工程:2003年5月9日完工启用。 嘉北车站新建工程:2005年9月8日完工启用。 大村车站新建工程:2006年4月4日完工启用。 五堵-汐科间高架化:包含五堵车站、汐止车站高架化工程，于2006年4月9日完工启用。 中坜车站股道改线工程:2006年6月底完工启用。 新左营车站新建工程:2006年12月1日完工启用。 新乌日车站新建工程:月台与衔接设施在2006年12月1日完工启用(后续工程仍在进行中)。 七堵车站站房改建工程:2007年1月完工启用(后续工程仍在进行中)。 百福车站新建工程:2007年5月8日完工启用。 竹南车站北半段站房改建工程:2007年11月完工启用。 汐科车站新建工程:2007年12月30日完工启用。 大林车站站房改建工程:2008年12月5日完工启用。 斗六车站站房改建工程:2008年12月16日完工启用。 竹南车站南半段站房改建工程:2009年1月完工启用。 浮洲车站兴建工程:2011年9月完工启用。沙仑线於 2012年01月01日启用。六家线 於 2011年11月11日 启用。 南科车站於2010年07月14日完工启用。 新乌日车站 於 2012年6月22日 正式全面启用。

樟树湾、环南路、三姓桥(南新竹)等车站设计中。 七堵-樟树湾间三轨化、莺歌-桃园间三轨化。 基隆车站进行整体改建，并与基隆市政府推动的"基隆火车站暨西二西三码头都市更新案"同步进行。 香山、彰化、沙鹿、民雄等车站计划改建中。

由铁路改建工程局办理 丰原-大庆间高架化。 新设丰南、头家厝、松竹、精武、五权等车站。

由铁路改建工程局办理 嘉北-北回归线间高架化。 迁移嘉义调车场并新设北回归线车站等车站。

由铁路改建工程局办理 大桥-台南航空站间地下化。 新设南台南车站、台南航空车站等车站。

由铁路改建工程局办理 计划兴建北宜直线铁路。 改善北回线安全设施。 台东线电气化。

由台湾铁路管理局台北工务段办理 高架化桃园车站、内坜车站、中坜车站等既有车站。 新设凤鸣车站、国际路车站、永丰路车站、中原大学车站等车站。